微生物環保廁所是近年來環保廁所的一種新型處理方式，這種環保廁所采用微生物降解的方式處理糞便，由于大小便后不用水沖，與其它同類廁所相比，大大節約了水資源。生態廁所中的糞便污物被微生物分解，沒有污物排出，連使用后的污紙也同時被微生物分解處理，真正做到零排放。

它的工作原理是采用微生物、鋸末、秸稈粉及高溫加工炭、水杉木片、生物纖維等材料，將糞尿進行無害化處理，資源化利用，制成有機肥料和葉面肥料，將充分利用自然資源，無廢水、廢渣排放。

微生物廁所處理設備采用微電腦、物理、機電為一體的自動化污物處理裝置，用特殊微生物菌種將污物在12小時內降解。微生物將這些廁所污物原地降解，微生物廁所底部還配備有糞便處理機，糞便處理機裝有除臭設備和除臭生物專門消除異味，因此廁所內沒有異味。

微生物降解型生態環保廁所對比傳統移動廁所具有節約資源、如廁環境好等優勢，具體的優勢有以下幾點：

1、微生物分解徹底，速度快無異味，無二次污染，完全不用水資源。

2、裝有除臭設備和除臭生物專門消除異味，如廁環境好。

3、控制系統自動化，全智能系統操作簡單，無需人工。

4、后期清掏方便，清掏次數少，清出廢物可作肥料。